ДНК-лігаза (АТФ або НАД+) EC#: 6.5.1.6; ChemWhat Код: 1383898
Назва продукту | ДНК-лігаза (ATP або NAD +) |
Приклад структури | |
Синоніми | ДНК-лігаза Tfu |
Номер EC | 6.5.1.6 |
CAS реєстраційний номер | |
Коментарі | Ферменти архей «Thermococcus fumicolans» та «Thermococcus onnurineus» виявляють високу активність як з АТФ, так і з НАД +, і значно нижчу активність з ТТР, ГТФ та СТР. Фермент каталізує лігування ланцюгів ДНК із 3′-гідроксильними та 5′-фосфатними кінцевими частинами, утворюючи фосфодіефір та ущільнюючи певні типи одноланцюгових розривів у дуплексній ДНК. Каталіз відбувається за триступеневим механізмом, починаючи з активації ферменту АТФ або НАД +, утворюючи фосфорамідний зв’язок між аденилатом та залишком лізину. Потім аденілатна група переноситься на 5′-фосфатний кінець субстрату, утворюючи обмежену структуру 5 ′ - (5′-дифосфоаденозин) - [ДНК]. Нарешті, фермент каталізує нуклеофільну атаку 3′-ОН-кінця на обмеженому кінці, що призводить до утворення фосфодіефірного зв’язку та вивільнення аденилата. На відміну від EC? 6.5.1.1, ДНК-лігази (ATP), EC? 6.5.1.2, ДНК-лігази (NAD +) та EC? 6.5.1.7, ДНК-лігази (ATP, ADP або GTP). |
Кофактор | |
Історія | |
Реакції | (1) Atp + (дезоксирибонуклеотид) (n) -3′-гідроксил + 5′-фосфо- (дезоксирибонуклеотид) (m) = (дезоксирибонуклеотид) (n + m) + Amp + дифосфат. (2) NAD (+) + (дезоксирибонуклеотид) (n) -3′-гідроксил + 5′-фосфо- (дезоксирибонуклеотид) (m) = (дезоксирибонуклеотид) (n + m) + Amp + бета-нікотинамід D-нуклеотид. |
Придбати реагент | |
Немає постачальника реагенту? | Надішліть швидкий запит на адресу ChemWhat |
Хочете бути вказаними тут як постачальники реагентів? (Платна послуга) | Натисніть тут, щоб зв’язатися ChemWhat |
Схвалені виробники | |
Хочете бути внесеним до списку схвалених виробників (потрібне затвердження)? | Будь ласка, завантажте та заповніть ця форма і надіслати назад до [захищено електронною поштою] |
Зверніться до нас за іншою допомогою | |
Зв'яжіться з нами для отримання іншої інформації або послуг | Натисніть тут, щоб зв’язатися ChemWhat |