ДНК-лігаза (ATP, ADP або GTP) EC #: 6.5.1.7

Назва продукту ДНК -лігаза (АТФ, АДФ або ГТФ)
Приклад структури Приклад Будова ДНК -лігази (АТФ, АДФ або ГТФ) EC#: 6.5.1.7
Синоніми Hbu ДНК-лігаза, множинна кофактор-залежна ДНК-лігаза, Szi ДНК-лігаза
Номер EC 6.5.1.7
CAS реєстраційний номер
Коментарі Ферменти з археї «Hyperthermus butylicus» та «Sulfophobococcus zilligii» активні з АТФ, АДФ або ГТФ. Вони не виявляють активності з NAD+. Фермент каталізує лігування ланцюгів ДНК з 3'-гідроксильними та 5'-фосфатними кінцівками, утворюючи фосфодіефір та ущільнюючи певні типи одноланцюгових розривів у дуплексній ДНК. Каталіз відбувається за триступеневим механізмом, починаючи з активації ферменту АТФ, АДФ або ГТФ, утворюючи фосфорамідний зв’язок між аденилатом/гуанілатом та залишком лізину. Потім нуклеотид переноситься на 5'-фосфатний кінець субстрату, утворюючи укриту структуру 5 ′-(5′-дифосфоаденозин/гуанозин)-[ДНК]. Нарешті, фермент каталізує нуклеофільну атаку кінця 3′-ОН на закритому кінці, що призводить до утворення фосфодіефірного зв’язку та вивільнення нуклеотиду. На відміну від ЕС? 6.5.1.1, ДНК -лігази (АТФ) та ЄС? 6.5.1.6, ДНК -лігази (АТФ або НАД+), які не можуть використовувати ГТФ.
Кофактор
Історія
Реакції (1) Atp + (дезоксирибонуклеотид) (n) -3′-гідроксил + 5′-фосфо- (дезоксирибонуклеотид) (m) = (дезоксирибонуклеотид) (n + m) + Amp + дифосфат. (2) Adp + (дезоксирибонуклеотид) (n) -3′-гідроксил + 5′-фосфо- (дезоксирибонуклеотид) (m) = (дезоксирибонуклеотид) (n + m) + Amp + фосфат. (3) Gtp + (дезоксирибонуклеотид) (n) -3′-гідроксил + 5′-фосфо- (дезоксирибонуклеотид) (m) = (дезоксирибонуклеотид) (n + m) + Gmp + дифосфат.

Придбати реагент

Немає постачальника реагенту? Надішліть швидкий запит на адресу ChemWhat
Хочете бути вказаними тут як постачальники реагентів? (Платна послуга) Натисніть тут, щоб зв’язатися ChemWhat

Схвалені виробники

Хочете бути зареєстрованим як затверджений виробник (безкоштовна послуга, але вимагає схвалення)? Будь ласка, завантажте та заповніть ця форма і надіслати назад до [захищено електронною поштою]

Більше постачальників

Watson International Limited Надішліть швидкий запит Ватсону
Хочете бути вказаними тут як постачальники? (Платна послуга) Натисніть тут, щоб зв’язатися ChemWhat

Зверніться до нас за іншою допомогою

Зв’яжіться з нами для отримання інших послуг, таких як передача технологій, синтетична література, пошук, реклама тощо. Натисніть тут, щоб зв’язатися ChemWhat